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ICANalytics métabolomique

 

Objectifs

En route pour la médecine personnalisée

La plateforme de métabolomique a pour but de développer et fournir des outils permettant de profiler et/ou quantifier en haut-débit l’ensemble des molécules appartenant au métabolome.

La stratégie développée au sein de notre plateforme se base sur le profilage d’un large nombre de métabolites en utilisant des compétences multidisciplinaires combinant des outils bioinformatiques, statistiques et des bases de données biochimiques pour l’interprétation des résultats à un spectromètre de masse à haute résolution couplé à des systèmes chromatographiques.

 

Services et Equipements

  • Etude du métabolome
  • Prestations: acquisition et interprétation de profils métabolomiques
  • Identification et analyse de métabolites (HRMS, MS/MS)
  • Analyse et quantification de plusieurs familles de métabolites
  • Conseil et mise en place des dosages métabolomiques
  • Développement et réalisation de méthodes pour la métabolomique (‘Custom method’)
  • Annotation et identification des métabolites

 

Famille de métabolites pouvant être quantifier (Absolu & relative)

Approche ciblée:

Quantification absolu des acides aminés, voie du tryptophane, voie du métabolisme de la choline, vitamines B, SCFAs (en dvlpt), acides biliaires (en dvlpt)

Méthode de profilage:

Détection et quantification relative de composés en lien avec le microbiote et appartenant à la famille :

  • Méthode 1: acides aminés, composés organiques, phénols, méthylamines et certains indoles
  • Méthode 2: Acylcarnitines, acides gras libres et acide biliaires
Approche non ciblée:

Etude du métabolome globale par l’intermédiaire de plusieurs méthodes chromatographiques. Détection de plus de 200 métabolites dans les biofluides (plasma-sérum)

Matrices biologiques d’études.

Sérum-Plasma, LCR, urines, fèces, Caecum, PBMC et cellules gliales. Autres matrices sous conditions d’études pilotes (Contacter le responsable opérationnel pour plus d’informations)

 

 

Soumission des projets

Accès à notre plateforme se fait par l’intermédiaire d’une demande analytique (https://app.novabricks.com/ican/ican/)

La démarche après réception du « request form » est la suivante :

  1. Soumission de la request form à la plate-forme
  2. Evaluation du projet et établissement d’une proposition tarifaire
  3. Validation du cahier des charges et signature d’un devis/convention
  4. Réception des échantillons
  5. Réalisation des travaux selon le cahier des charges (ou le devis)
  6. Présentation du rapport final d’étude

 

Publications majeures

  • Garali I, Adanyeguh IM, Ichou F, Perlbarg V, Seyer A, Colsch B, Moszer I, Guillemot V, Durr A, Mochel F, Tenenhaus A. A strategy for multimodal data integration: application to biomarkers identification in spinocerebellar ataxia. Briefings in Bioinformatics. 2017
  • Kayser BD, Lhomme M, Dao MC, Ichou F, Bouillot JL, Prifti E, Kontush A, Chevallier JM, Aron-Wisnewsky J, Dugail I, Clément K, Serum lipidomics reveals early differential effects of gastric bypass compared to banding on phospholipids and sphingolipids independent of differences in weight loss. Int. J. Obes. 2017  PMID: 28280270
  • Béliard S, Le Goff W, Saint-Charles F, Poupel L, Deswaerte V, Bouchareychas L, Huby T, Lesnik P. Modulation of Gr1low monocyte subset impacts insulin sensitivity and weight gain upon high-fat diet in female mice. Int. J. Obes. 2017 PMID: 28769122

 

Localisation et Contacts

47-48 bd de l’hôpital 75013 Paris ICAN – bât E3M – 6ème étage

Responsable opérationnel: Farid ICHOU, PhD
Directeur scientifique: Philippe LESNIK, PhD